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Small and microRNA Sequencing
Erkunden Sie die regulatorische Landschaft nicht-kodierender RNAs
Unser Small RNA Sequenzierungsservice ermöglicht Ihnen die Untersuchung posttranskriptioneller Regulation, die Entdeckung neuer Small RNAs sowie die Identifikation zustandsspezifischer Biomarker. Ob in der Grundlagenforschung oder in der Wirkstoffentwicklung – dieser Service ergänzt klassische RNA-Seq mit einer entscheidenden Informationsebene.
Unser Small RNA Sequenzierungsservice ermöglicht Ihnen die Untersuchung posttranskriptioneller Regulation, die Entdeckung neuer Small RNAs sowie die Identifikation zustandsspezifischer Biomarker. Ob in der Grundlagenforschung oder in der Wirkstoffentwicklung – dieser Service ergänzt klassische RNA-Seq mit einer entscheidenden Informationsebene.
Was Sie erreichen können
- Regulatorische Wirkung von miRNA, piRNA und anderen Small RNAs aufdecken
- Neue Small RNA-Spezies und Expressionsprofile identifizieren
- Biomarker unter bestimmten physiologischen oder krankheitsbezogenen Bedingungen detektieren
- Genregulation in funktionellen oder therapeutischen Studien untersuchen
- Wirkstoffentwicklung und Zielvalidierung unterstützen
- Ihre Omics-Daten mit Erkenntnissen zu nicht-kodierenden RNAs ergänzen
Bevor Sie starten
Wir unterstützen Sie vom Versuchsdesign bis zur Analyse. Klären Sie idealerweise vorab:
- Welche Small-RNA-Typen und Größenbereiche werden erwartet (bekannt vs. neu)?
- Welche Probenarten werden verwendet (z. B. Serum, Zellen, Gewebe, Organismen)?
- Welche Sequenziertiefe und Replikatzahl sind für zuverlässige Ergebnisse notwendig?
- Ist das Organismusgenom gut annotiert oder ist eine de novo-Analyse erforderlich?
- Gibt es geeignete Referenzdatenbanken für miRNA/piRNA?
Modularer Workflow
Lagern Sie den gesamten Workflow aus oder wählen Sie einzelne Module. Unser Prozess ist flexibel aufgebaut. Typische Schritte:
Bioinformatische Analyse
Unsere Standardpipeline liefert sowohl Tiefe als auch Klarheit, inklusive:
- Daten-QC & Filterung: Qualitätskontrolle der Rohdaten, Trimming, Längenfilterung
- Mapping & Quantifizierung: Alignment an Referenzgenome und RNA-Datenbanken
- Klassifikation: Zuordnung bekannter Small-RNA-Klassen (z. B. miRNA, piRNA, snoRNA)
- Neuentdeckung: Vorhersage neuer Small-RNA-Kandidaten
- Expressionsanalyse: Differenzielle Expression zwischen Bedingungen oder Behandlungen
- Target-Gen-Annotation: Zielvorhersage und funktionelle Analyse (GO- und KEGG-Anreicherung)
- Motivanalyse: Erkennung von Sequenzmotiven in neuen miRNAs
Sie erhalten Rohdaten, normalisierte Datensätze und publikationsreife Zusammenfassungen.
Bearbeitungszeit
- 25 Arbeitstage für Bibliotheksvorbereitung und Sequenzierung
- +10 Arbeitstage für Standard-Bioinformatik
- Express-Service auf Anfrage möglich
Probenanforderungen
- Pufferempfehlung: 10 mM Tris-HCl (pH 7,0)
- Wichtig: Vermeiden Sie Puffer mit EDTA >1 mM
- RNA-Quantifizierung: Fluorometrische Methoden (z. B. PicoGreen®, Qubit®)
Minimale Inputmenge für Illumina-Sequenzierung:
| Library Typ | Menge (µg) | Konzentration (ng/µl) |
| Small RNA / miRNA (total RNA) | >1.0 | >20 |