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Small and microRNA Sequencing

Découvrez le paysage de régulation des ARN non codants
Notre service de séquençage des petites ARNs vous permet d’explorer la régulation post-transcriptionnelle, de découvrir de nouvelles petites ARNs et d’identifier des biomarqueurs spécifiques à certaines conditions. Que vous soyez en recherche fondamentale ou en développement pharmaceutique, ce service apporte une couche d’information essentielle au-delà de la ARN-seq classique.
Notre service de séquençage des petites ARNs vous permet d’explorer la régulation post-transcriptionnelle, de découvrir de nouvelles petites ARNs et d’identifier des biomarqueurs spécifiques à certaines conditions. Que vous soyez en recherche fondamentale ou en développement pharmaceutique, ce service apporte une couche d’information essentielle au-delà de la ARN-seq classique.
Ce que vous pouvez accomplir
- Révéler l’impact régulateur des miARNs, piARNs et autres petites ARNs
- Identifier de nouvelles espèces de small ARNs et leurs profils d’expression
- Détecter des biomarqueurs sous conditions physiologiques ou pathologiques spécifiques
- Étudier la régulation génique dans des contextes fonctionnels ou thérapeutiques
- Appuyer la découverte de médicaments et la validation de cibles
- Compléter vos données omiques avec des informations sur les ARN non codants
Avant de commencer
Nous vous accompagnons de la conception expérimentale à l’analyse. Questions clés à clarifier :
- Quels types et tailles de small RNAs sont attendus (connus ou nouveaux) ?
- Quels types d’échantillons sont utilisés (ex. : sérum, cellules, tissus, organismes) ?
- Quelle profondeur de séquençage et combien de réplicats sont nécessaires ?
- Votre organisme est-il bien annoté, ou faut-il envisager une découverte de novo ?
- Existe-t-il des bases de données miRNA/piRNA pertinentes pour votre projet ?
Workflow modulaire
Externalisez le workflow complet ou sélectionnez les modules souhaités. Notre approche est conçue pour être flexible. Étapes typiques :
Analyse bioinformatique
Notre pipeline standard offre profondeur et clarté, incluant :
- Contrôle qualité & filtrage : Contrôle qualité des données brutes, découpage et filtrage selon la longueur
- Alignement & quantification : Alignement sur génomes de référence et bases de données ARN
- Classification : Attribution aux classes connues (miARN, piARN, snoARN)
- Découverte de novo : Prédiction de nouvelles small ARNs
- Analyse d’expression : Expression différentielle selon les conditions ou traitements
- Annotation des gènes cibles : Prédiction et analyse fonctionnelle (enrichissement GO et KEGG)
- Analyse de motifs : Détection de motifs dans les nouvelles miARNs
Vous recevrez les fichiers bruts, les données normalisées et des résumés prêts à publier.
Délais de livraison
- 25 jours ouvrables pour la préparation de bibliothèque et le séquençage
- +10 jours ouvrables pour l’analyse bioinformatique standard
- Service express disponible sur demande
Exigences pour les échantillons
- Tampon recommandé : 10 mM Tris-HCl (pH 7,0)
- Important : Évitez les tampons contenant >1 mM d’EDTA
- Quantification de l’ARN : Méthodes fluorométriques (ex. PicoGreen®, Qubit®)
Quantité minimale pour séquençage Illumina :
Type de bibliothèque | Quantité (µg) | Concentration (ng/µl) |
Small RNA / miRNA (total RNA) | >1.0 | >20 |