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Séquençage des Petits ARN et des microARN
- Étudier l'influence d'ARN non codants sur l'expression des gènes
- Découvrez de nouveaux éléments et des systèmes de régulation
Aperçu
Considérations avant de commencer un projet de séquençage de petits ARN :
- Petite fraction de l'ARN, tailles attendues ?
- Types d'échantillons (sérum, types de cellules, tissus) ?
- Profondeur de séquençage (sensibilité) ?
- Réplicas (indice de confiance) ?
- Nouveaux types d'ARN et/ou petits ARN connus ?
- Organisme modèle ou aucune référence dans la base de données disponible ?
Laissez-nous vous guider - de la conception à l'analyse
Exemples de projets utilisant le séquençage de petits ARN :
- Etudes de la régulation post-traductionnel
- Découverte de nouveaux éléments régulateurs
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Détection de biomarqueurs sous des conditions particulières
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Expériences de génétique fonctionnelle pour découvrir des gènes de régulation
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Partie d'un projet de caractérisation en sciences omiques
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Découverte de médicaments, identification de candidats, nouvelles thérapies
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Découverte de nouveaux ARN non codants régulateurs.
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Effets sur les tissus d'ARN interagissant avec Piwi et micro-ARN
Applications liées au séquençage de petits ARN :
- Séquençage de l'ARN
Déroulement
Résultats
Les résultats produits par notre module d'analyse aident à répondre à trois questions principales d'une expérience de séquençage des miRNA visant par exemple à trouver des biomarqueurs pour une maladie spécifique.
- Y a-t-il différents modèles d'expression des miRNA dans une expérience ? (voir figure 1)
- Lequel des miRNA exprimés est nouveau ? (voir tableau 1)
- Quels sont les motifs enrichis dans les données miRNA ? (voir figure 2)
Figure 1: Cette figure montre une analyse en composantes principales (ACP) basée sur les modèles d'expression normalisés des échantillons analysés et illustre leur similarité les uns par rapport aux autres. Elle permet ainsi de déterminer si les conditions utilisées dans l'expérience conduisent à des Voies d'expression différentes des miRNA.
Figure 2: Les motifs enrichis sont détectés et visualisés des données de significativité et des informations supplémentaires (non présentées)
Délai d'exécution
- Livraison des données dans les 25 jours ouvrables suivant la réception de l'échantillon (y compris la préparation de la bibliothèque et le séquençage)
- 10 jours ouvrables supplémentaires pour l'analyse des données (bioinformatique)
- Service express possible sur demande