Small and microRNA Sequencing

Découvrez le paysage de régulation des ARN non codants
Notre service de séquençage des petites ARNs vous permet d’explorer la régulation post-transcriptionnelle, de découvrir de nouvelles petites ARNs et d’identifier des biomarqueurs spécifiques à certaines conditions. Que vous soyez en recherche fondamentale ou en développement pharmaceutique, ce service apporte une couche d’information essentielle au-delà de la ARN-seq classique.

Ce que vous pouvez accomplir

Révéler l’impact régulateur des miARNs, piARNs et autres petites ARNs
Identifier de nouvelles espèces de small ARNs et leurs profils d’expression
Détecter des biomarqueurs sous conditions physiologiques ou pathologiques spécifiques
Étudier la régulation génique dans des contextes fonctionnels ou thérapeutiques
Appuyer la découverte de médicaments et la validation de cibles
Compléter vos données omiques avec des informations sur les ARN non codants

Avant de commencer

Nous vous accompagnons de la conception expérimentale à l’analyse. Questions clés à clarifier :

Quels types et tailles de small RNAs sont attendus (connus ou nouveaux) ?
Quels types d’échantillons sont utilisés (ex. : sérum, cellules, tissus, organismes) ?
Quelle profondeur de séquençage et combien de réplicats sont nécessaires ?
Votre organisme est-il bien annoté, ou faut-il envisager une découverte de novo ?
Existe-t-il des bases de données miRNA/piRNA pertinentes pour votre projet ?

Workflow modulaire

Externalisez le workflow complet ou sélectionnez les modules souhaités. Notre approche est conçue pour être flexible. Étapes typiques :

Analyse bioinformatique

Notre pipeline standard offre profondeur et clarté, incluant :

Contrôle qualité & filtrage : Contrôle qualité des données brutes, découpage et filtrage selon la longueur
Alignement & quantification : Alignement sur génomes de référence et bases de données ARN
Classification : Attribution aux classes connues (miARN, piARN, snoARN)
Découverte de novo : Prédiction de nouvelles small ARNs
Analyse d’expression : Expression différentielle selon les conditions ou traitements
Annotation des gènes cibles : Prédiction et analyse fonctionnelle (enrichissement GO et KEGG)
Analyse de motifs : Détection de motifs dans les nouvelles miARNs

Vous recevrez les fichiers bruts, les données normalisées et des résumés prêts à publier.

Délais de livraison

25 jours ouvrables pour la préparation de bibliothèque et le séquençage
+10 jours ouvrables pour l’analyse bioinformatique standard
Service express disponible sur demande

Exigences pour les échantillons

Tampon recommandé : 10 mM Tris-HCl (pH 7,0)
Important : Évitez les tampons contenant >1 mM d’EDTA
Quantification de l’ARN : Méthodes fluorométriques (ex. PicoGreen®, Qubit®)

Quantité minimale pour séquençage Illumina :

Type de bibliothèque	Quantité (µg)	Concentration (ng/µl)
Small RNA / miRNA (total RNA)	>1.0	>20