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Small and microRNA Sequencing

Small and microRNA Sequencing
 
 
Découvrez le paysage de régulation des ARN non codants
Notre service de séquençage des petites ARNs vous permet d’explorer la régulation post-transcriptionnelle, de découvrir de nouvelles petites ARNs et d’identifier des biomarqueurs spécifiques à certaines conditions. Que vous soyez en recherche fondamentale ou en développement pharmaceutique, ce service apporte une couche d’information essentielle au-delà de la ARN-seq classique.

Ce que vous pouvez accomplir

  • Révéler l’impact régulateur des miARNs, piARNs et autres petites ARNs
  • Identifier de nouvelles espèces de small ARNs et leurs profils d’expression
  • Détecter des biomarqueurs sous conditions physiologiques ou pathologiques spécifiques
  • Étudier la régulation génique dans des contextes fonctionnels ou thérapeutiques
  • Appuyer la découverte de médicaments et la validation de cibles
  • Compléter vos données omiques avec des informations sur les ARN non codants

Avant de commencer

Nous vous accompagnons de la conception expérimentale à l’analyse. Questions clés à clarifier :

  • Quels types et tailles de small RNAs sont attendus (connus ou nouveaux) ?
  • Quels types d’échantillons sont utilisés (ex. : sérum, cellules, tissus, organismes) ?
  • Quelle profondeur de séquençage et combien de réplicats sont nécessaires ?
  • Votre organisme est-il bien annoté, ou faut-il envisager une découverte de novo ?
  • Existe-t-il des bases de données miRNA/piRNA pertinentes pour votre projet ?

Workflow modulaire

Externalisez le workflow complet ou sélectionnez les modules souhaités. Notre approche est conçue pour être flexible. Étapes typiques :

Analyse bioinformatique

Notre pipeline standard offre profondeur et clarté, incluant :

  • Contrôle qualité & filtrage : Contrôle qualité des données brutes, découpage et filtrage selon la longueur
  • Alignement & quantification : Alignement sur génomes de référence et bases de données ARN
  • Classification : Attribution aux classes connues (miARN, piARN, snoARN)
  • Découverte de novo : Prédiction de nouvelles small ARNs
  • Analyse d’expression : Expression différentielle selon les conditions ou traitements
  • Annotation des gènes cibles : Prédiction et analyse fonctionnelle (enrichissement GO et KEGG)
  • Analyse de motifs : Détection de motifs dans les nouvelles miARNs

Vous recevrez les fichiers bruts, les données normalisées et des résumés prêts à publier.

Délais de livraison

  • 25 jours ouvrables pour la préparation de bibliothèque et le séquençage
  • +10 jours ouvrables pour l’analyse bioinformatique standard
  • Service express disponible sur demande

Exigences pour les échantillons

  • Tampon recommandé : 10 mM Tris-HCl (pH 7,0)
  • Important : Évitez les tampons contenant >1 mM d’EDTA
  • Quantification de l’ARN : Méthodes fluorométriques (ex. PicoGreen®, Qubit®)

Quantité minimale pour séquençage Illumina :

Type de bibliothèque Quantité (µg) Concentration (ng/µl)
Small RNA / miRNA (total RNA) >1.0 >20