Séquençage des Petits ARN et des microARN

Utilisez le séquençage de petits ARN pour:

Étudier l'influence d'ARN non codants sur l'expression des gènes
Découvrez de nouveaux éléments et des systèmes de régulation

Le séquençage des petits ARN va de paire avec le séquençage de l'ARN, de la recherche fondamentale aux nouvelles approches thérapeutiques.

Aperçu

Considérations avant de commencer un projet de séquençage de petits ARN :

Petite fraction de l'ARN, tailles attendues ?
Types d'échantillons (sérum, types de cellules, tissus) ?
Profondeur de séquençage (sensibilité) ?
Réplicas (indice de confiance) ?
Nouveaux types d'ARN et/ou petits ARN connus ?
Organisme modèle ou aucune référence dans la base de données disponible ?

Laissez-nous vous guider - de la conception à l'analyse

Exemples de projets utilisant le séquençage de petits ARN :

Etudes de la régulation post-traductionnel
Découverte de nouveaux éléments régulateurs
Détection de biomarqueurs sous des conditions particulières
Expériences de génétique fonctionnelle pour découvrir des gènes de régulation
Partie d'un projet de caractérisation en sciences omiques
Découverte de médicaments, identification de candidats, nouvelles thérapies
Découverte de nouveaux ARN non codants régulateurs.
Effets sur les tissus d'ARN interagissant avec Piwi et micro-ARN

Applications liées au séquençage de petits ARN :

Séquençage de l'ARN

Déroulement

Le graphique ci-dessous illustre un déroulement typique d'un projet de petits ARN ou de miRNA. Veuillez noter que nos processus organisés en modules vous offrent diverses options d'entrée et de sortie. Yous pouvez externaliser la totalité de votre projet NGS à Microsynth ou seulement une partie de celui-ci, c'est à vous de décider.

Pour plus d'informations et une description technique détaillée, veuillez télécharger notre note d'application "Small RNA Sequencing" (voir les téléchargements correspondants).

Résultats

Les résultats produits par notre module d'analyse aident à répondre à trois questions principales d'une expérience de séquençage des miRNA visant par exemple à trouver des biomarqueurs pour une maladie spécifique.

Y a-t-il différents modèles d'expression des miRNA dans une expérience ? (voir figure 1)
Lequel des miRNA exprimés est nouveau ? (voir tableau 1)
Quels sont les motifs enrichis dans les données miRNA ? (voir figure 2)

Figure 1: Cette figure montre une analyse en composantes principales (ACP) basée sur les modèles d'expression normalisés des échantillons analysés et illustre leur similarité les uns par rapport aux autres. Elle permet ainsi de déterminer si les conditions utilisées dans l'expérience conduisent à des Voies d'expression différentes des miRNA.

Table 1: Tableau de résultats montrant le nombre brut de miRNA séquencés et leur similarité avec les miRNA déjà connus. Toutes les séquences de miRNA non appariées et donc éventuellement nouvelles, ainsi que leurs fréquences, sont répertoriées pour d'éventuelles recherches complémentaires.

Figure 2: Les motifs enrichis sont détectés et visualisés des données de significativité et des informations supplémentaires (non présentées)

Délai d'exécution

Livraison des données dans les 25 jours ouvrables suivant la réception de l'échantillon (y compris la préparation de la bibliothèque et le séquençage)
10 jours ouvrables supplémentaires pour l'analyse des données (bioinformatique)
Service express possible sur demande