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Frequently Asked Questions - Next Generation Sequencing

Proben und Library Erstellung

Führen Sie vor der Library Preparation eine Qualitätskontrolle durch?

Ja, wir führen eine gründliche Eingangsqualitätskontrolle Ihrer Proben durch. Stellen Sie dennoch sicher, dass Sie Ihre eigene Qualitätskontrolle durchführen, bevor Sie die Proben versenden, um Verzögerungen oder andere Probleme bei der Verarbeitung zu vermeiden.

Wie lange lagern Sie meine DNA/RNA-Proben und kundenspezifischen Primer?
  • Proben werden 3 Monate lang gelagert
  • Benutzerdefinierte NGS-Primer werden 2 Jahre lang aufbewahrt
Wann sollte ich NextGen und wann sollte ich die Sanger-Technologie für die Amplikonsequenzierung verwenden?

Dies ist eher schwierig pauschal zu beantworten, am besten Sie kontaktieren uns, um Ihr Projekt im Detail zu besprechen.

Wie sollte ich die Proben in einer 96-Well-Platte anordnen, um die Probenverarbeitung so einfach wie möglich zu gestalten?

Bitte füllen Sie alle Wells spaltenweise.
Bei Projekten mit mehr als 4 x 96-Well-Platten setzen Sie sich bitte mit uns in Verbindung, um ein effizientes Plattendesign zu besprechen.

Sequenzierung

Wie wirken sich Sequenziertiefe, Leselänge und Replikate auf mein Projekt aus?

Um es einfach auszudrücken:

  • Sequenziertiefe bedeutet Sensitivität
  • Read-Länge bedeutet Spezifität
  • Replikate bedeuten Konfidenz

Bioinformatik

Wie lange speichern Sie meine Daten?

Die Daten werden für 3 Monate gespeichert.

Analysieren Sie bereits vorhandene NGS-Daten?

Ja, das tun wir, bitte beachten Sie unsere Dienstleistungen und kontaktieren Sie unsere Bioinformatik-Spezialisten.

Warum brauche ich ein Referenzgenom?

Neben der Resequenzierung sind viele Anwendungen wie z. B. die Transkriptomsequenzierung auf ein qualitativ hochwertiges Referenzgenom als Basis für die tiefergehende Analyse angewiesen. Die vollständige Referenzsequenz stellt sicher, wo gezählt werden soll, während die vollständige Referenzannotation sicherstellt, was gezählt werden soll. Zusätzliche Annotationen eines Referenzgenoms ermöglichen weitere tiefere Analysen wie z. B. die Analyse von Signalwegen, die Erkennung alternativer Transkripte,...

Was ist, wenn es kein Referenzgenom oder nur einen Assemblierungsentwurf des Genoms gibt?

Es gibt immer Workarounds - bitte sehen Sie sich unseren Service "Reference Transcriptome Sequencing" an und kontaktieren Sie uns für Details.