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Ecoli NightSeq

 
 
Innovativer neuer Sanger-Sequenzierservice in 1,5 ml Tubes und 96-well Platten für Plasmide. Werfen Sie Ihre E. coli Kolonien in eine Microsynth Dropbox, erhalten Sie Ihr Ergebnis am nächsten Tag* vor 14 Uhr und beschleunigen Sie Ihre Forschung um einen Tag.
 
 
*nur gültig für Drop Boxen in der Schweiz, in Frankreich und in Deutschland, die an unser Same-Day-Kuriersystem angeschlossen sind

Features and Benefits

 
Zusätzlich zu den Eigenschaften und Vorteilen, die Sie vom Economy Run kennen, bietet der Ecoli NightSeq folgende Vorteile:
 
Schnell
  • Übernachtservice, Zustellung der Ergebnisse vor 14 Uhr am nächsten Tag (gilt nur für Dropboxen, die an unser Kuriersystem für den gleichen Tag angeschlossen sind)
  • Ergebnisse werden von Montag bis Freitag zugestellt
 
Praktisch
  • Nutzen Sie unsere Dropbox in Ihrer Nähe für den kostenlosen Versand von Proben
  • Sie können zwischen Prepaid- und Non-Prepaid-Service wählen
 
Robust
  • Ideal für schwierige Plasmide. Bessere und robustere Ergebnisse, da der gesamte Prozess standardisiert ist und intern durchgeführt wird.
 
Kostengünstig
  • Beschleunigen Sie Ihre Forschung um einen Arbeitstag
  • Sparen Sie Zeit im Labor
  • Reduzieren Sie Ihre Ausgaben für Plasmid-DNA-Aufreinigungskits erheblich, indem Sie nur Plasmide von Klonen isolieren, die die gewünschte Sequenz aufweisen
 
Vielseitig
  • Anwendbar fuer eine Vielzahl unterschiedlicher E. coli Wirtsstämme (Gefahrengruppe S1).
  • Sehr gute Resultate auch mit low-copy Plasmiden
     

Wie bestellen

 
 
Vorgehen bei der Bestellung von Etiketten für unseren Ecoli NightSeq:
 
  • Besuchen Sie unseren Webshop
  • Klicken Sie auf Tubes oder Plates unter "Ecoli NightSeq" und folgen Sie den weiteren Anweisungen
  • Sie können zwischen Prepaid- und Non-Prepaid-Etiketten wählen
 
Vorgehen zur Verwendung unseres Ecoli NightSeq für die Sequenzierung:
 
  • Besuchen Sie unseren Webshop
  • Klicken Sie auf den gewünschten Service unter "Ecoli NightSeq" (Prepaid oder Non-Prepaid) und folgen Sie den weiteren Anweisungen
 
Lesen Sie auch den User Guide von Microsynth auf der rechten Seite für weitere Informationen.

FAQ

Technische Fragen

Muss ich in die Flüssigkeit Antibiotika beifügen?

Nein, ein Antibiotikum ist nicht notwendig.

Muss ich wirklich von einer Kolonie picken, die einen Durchmesser von mindestens 1 mm hat?

Die Kolonie kann etwas kleiner sein, aber sie muss deutlich sichtbar sein.

Ich möchte das Ecoli NightSeq® Tube animpfen und auf einer Agarplatte mit demselben Zahnstocher ausstreichen. Was soll ich zuerst tun: das Ecoli NightSeq®-Röhrchen beimpfen oder meine Agarplatte ausstreichen?

Zuerst das Ecoli NightSeq® Tube beimpfen.

Funktioniert Ecoli NightSeq® auch für Low-Copy-Plasmide?

Ja.

Ich arbeite nicht mit Agarplatten, sondern mit Flüssigkultur. Kann ich die Ecoli NightSeq® Tubes auch mit Flüssigkultur beimpfen?

Ja, bitte geben Sie 5 µl hinzu.

Wie lange lagert Microsynth meine Ecoli NightSeq®-Proben?

Isolierte Proben werden einen Monat gelagert.

Funktioniert Ecoli NightSeq® auch für BAC oder andere Organismen?

Ja, wir wissen dass Ecoli NightSeq® für BACs und andere Organismen funktioniert, jedoch in manchen Fällen nicht so erfolgreich wie für E.coli. Deshalb empfehlen wir vorgängige Pilotversuche. Eine gute Methode um die Qualitaet zu steigern ist es, eine Rohisolation vom Plasmid / BAC zu machen und davon 1 µl in das Ecoli NightSeq® Tube zu geben.

Wir hatten gute Ergebnisse mit:

- Direktentnahme von Pseudomonas putida, Sinorhizobium meliloti, Fusobacterium nucleatum, Bacillus megaterium, Priestia megaterium. Wir empfehlen, es zu versuchen und im Falle eines Misserfolgs das Plasmid zu isolieren und 1 µl in unsere Röhrchen zu geben.
- Hefe, die in 20mM NaOH bei 95°C, 10 min. vorbehandelt wurde. Geben Sie 5 µl in unsere Ecoli NightSeq®-Röhrchen und erhitzen Sie diese für 15 Minuten auf 95 °C.

Stabilität

Wie lange kann ich Ecoli NightSeq® Tubes verwenden? Unter welchen Bedingungen muss ich sie lagern?

Lagerzeit für Ecoli NightSeq® Tubes ist 4 Jahre. Lagerbedingung für Ecoli NightSeq® Tubes ist  4 °C . Ablaufdatum und Lagerbedingungen sind auf der Verpackung ersichtlich.

Mehrere Reaktionen von einem Klon

Ich möchte einen Klon auswählen und eine Vorwärts- und eine Rückwärtssequenzierung durchführen. Ist das möglich?

Ja. Es gibt es Möglichkeiten:

  1. Sie picken eine Kolonie in ein Ecoli NightSeq® Tube, mischen und überführen die Flüssigkeit in ein zweites Ecoli NightSeq® Tube, mischen nochmal und teilen die Flüssigkeit auf die zwei Ecoli NightSeq® Tubes auf. Somit ist die Zelldichte in beiden Tubes gleich.
  2. Sie picken eine Kolonie in ein Ecoli NightSeq® Tube und kleben ein Ecoli NightSeq® Label darauf. Diesem Ecoli NightSeq® Tube legen Sie ein zweites Ecoli NightSeq® Label im transparenten Probenbeutel bei.


In beiden Fällen müssen die Vorwärts- und die Rückwärtsreaktion im Webshop-Formular bestellt werden.

Ich möchte eine weitere Reaktion mit einem anderen Primer machen nachdem ich das Sequenzierresultat erhalten habe. Ist das möglich?

Ja, für Tubes. Gehen Sie folgend vor:

  1. Da Microsynth schon das Isolat hat können weitere Reaktionen über den günstigeren Economy Run Service bestellt werden. Sie gehen dafür in die Economy Run Bestellmaske und definieren die zusätzlichen Reaktionen indem Sie prepaid Barcode Labels verwenden.
  2. Auf der letzten Seite der Bestellmaske müssen Sie dann folgende Information ins Comment Feld schreiben: Verwenden Sie bitte Proben aus Auftrag (order number XY).

Wichtig:

  1. Isolate sind 4 Wochen zur Verfügung
  2. Zusätzliche Reaktionen werden so schnell als möglich prozessiert, aber ohne Zeitversprechen.
  3. Kontaktieren Sie uns bitte wenn Sie keinen Zugang zu prepaid Economy Run Labels haben, um eine Lösung zu finden (non prepaid Version vom Microsynth Economy Run Service).

 

Logistik

Ich habe keine Microsynth Dropbox in meiner Nähe. Kann ich auch per Post schicken, auch wenn die Lieferung über das Wochenende liegen bleibt?

Ja. Wir haben eine entsprechend lange Lagerung bei Raumtemperatur getestet und es schadet der Probe nicht.

Erhalte ich die Ergebnisse am Samstag, wenn ich die Proben am Freitag in die Dropbox einwerfe?

Nein, erst am Montag vor 14 Uhr.

Wie soll ich den Sequenzierprimer schicken / beschriften?

Auf die gleiche Weise wie bei unseren anderen Sequenzierservices.
Primer Konzentration 10 µM, mindestens 20 µl Volumen und schreiben Sie den Namen des Primers auf das Röhrchen.

Was muss ich beachten, wenn ich lebende GVOs zu Microsynth schicke?

Genetisch veränderte Mikroorganismen (GVO), die nicht der Definition von toxischen oder infektiösen Stoffen entsprechen, aber in der Lage sind, Tiere, Pflanzen oder mikrobielle Substanzen in einer Weise zu verändern, die normalerweise nicht aus natürlicher Vermehrung resultiert, gehören zur Klasse 9 und sind der UN3245 zuzuordnen und in Übereinstimmung mit der Verpackungsvorschrift P904 zu versenden.
Kurz gesagt bedeutet dies, dass die Proben in einer inneren, einer sekundären und einer äußeren Verpackung verpackt werden müssen. Die Innenverpackung besteht aus einem lecksicheren Primärgefäß und einem absorbierenden Material, das zwischen dem Primärgefäß und der Sekundärverpackung (z.B. Plastikbeutel) platziert wird. Die Außenverpackung muss für ihr Fassungsvermögen, ihre Masse und ihren Verwendungszweck ausreichend stabil sein und eine Mindestaußenabmessung von 100 mm aufweisen.
Weitere Informationen finden Sie unter https://adrbook.com/en/2017/Sutun/8/P904.

Wenn GVOs nicht der UN3245/Klasse 9 zugeordnet werden können (was für die meisten E. coli-Laborstämme und Vektoren zutrifft), unterliegen sie nicht den Gefahrgutvorschriften.

GVO unterliegen nicht den Gefahrgutvorschriften, wenn sie von den zuständigen Behörden der Herkunfts-, Transit- und Bestimmungsländer zur Verwendung zugelassen sind.

Testimonials

 
 
“The main benefits of Ecoli NightSeq are saving one day as well as saving time and consumable costs for the mini-prep of 3-5 picked colonies from each clone. Another benefit is that Microsynth Seqlab provides the option for standard primers, which makes life easier for many constructs. In terms of quality, whenever poor sequence reads were found, Microsynth Seqlab has repeated the sequencing with no extra cost. Taken together, I’m extremely satisfied with the new Ecoli NightSeq service, an additional high standard sequencing service from Microsynth Seqlab.”

Dr. Shubhendu Palei, TU Dortmund

 

“Thanks to the new Ecoli NightSeq service from Microsynth, we are now able to sequence in high-throughput format and save up to two days compared to the previous service. Time really is money for us since we can significantly shorten critical project timelines. The easy sample preparation, the high-quality sequences, the long read-lengths as well as the competent, fast and uncomplicated customer support were convincing us, too.”
Andreas Lehmann, Molecular Partners AG

 

“We’ve been using the Ecoli NightSeq service proposed by Microsynth for 6 months now and have only seen advantages to the system. It allows you to save one day in your cloning process by sending directly your colonies for sequencing. The most important aspect is that you do not need to extract the DNA saving bench time and money. This reduces in effect the general price of the read. We’ve been surprised by the quality of the reads which you cannot distinguish from extracted DNA reads. Overall, it’s a plus!”

Thomas Lunardi, EPFL SV ISREC UPLIN

 

“I have used the Ecoli NightSeq service primarily to test whether a site directed mutagenesis has worked, as well as to check cloned CrisprCas9 plasmids. For such applications this service is very convenient, as they need to be confirmed with sequencing anyways and hence Ecoli NightSeq allowed me to save unnecessary minipreps.”

Barbara Hauert, University of Bern

 

Produkt Video

 
 
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