Full PlasmidSeq

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>15 µl à 20 ng/µl

Nous fournissons des informations supplémentaires qui vous permettent d'identifier les régions problématiques et d'évaluer la qualité globale du séquençage :

• Dans le fichier *.variable.tsv qui s'ouvre avec Excel, tous les résidus du contig sont listés et présentent un taux >10% de mésappariements, de délétions et/ou d'insertions. Ces valeurs sont basées sur toutes les reads utilisées pour créer le contig. Vous pouvez trier la liste en fonction du % de mésappariements, du % de délétions ou du % d'insertions afin d'identifier les régions de votre plasmide susceptibles de poser problème ou d'être ambiguës. La couverture, ainsi que la qualité des bases des reads à la position respective sont également indiquées.
• Dans le fichier *.cleaned.html de l'addendum, vous pouvez voir les statistiques des reads qui ont été utilisées pour produire l'assemblage, qui comprennent le nombre de reads, la longueur des reads et le score de qualité des reads.

Veuillez consulter les informations complémentaires pour juger de la qualité de la séquence au niveau de la position. Pour les applications critiques, nous vous recommandons de vérifier la séquence avec une méthode de séquençage orthogonale telle que Sanger ou Illumina.

Veuillez comprendre que nous ne pouvons pas fournir d'assistance scientifique à ce niveau. Notre assistance est limitée aux questions techniques concernant la qualité du séquençage, la qualité de l'échantillon ou les anomalies techniques dans le séquençage.

Si vous travaillez sous Windows, vous pouvez activer l'affichage des extensions de noms de fichiers (dans l'explorateur de fichiers, sous Affichage, dans le groupe Afficher/Masquer, cochez la case Extensions de noms de fichiers). Par exemple, les fichiers de valeurs séparées par des tabulations (.tsv) peuvent être ouverts dans n'importe quel éditeur de texte ou par glisser-déposer dans un tableau Excel ouvert mais vide. Les fichiers Fasta (.fasta) et genbank (.gbk) peuvent être ouverts dans un éditeur de texte ou par un logiciel spécialisé.