Séquençage de Transcriptome de Référence

Utilisez le séquençage de transcriptome de référence pour :

Effectuer une analyse différentielle de l'expression des gènes lorsqu'il n'y a pas de génome de référence
Découvrir l'expression différentielle des gènes non étudiés

Aperçu

Considérations avant de commencer un projet de séquençage de transcriptome de référence :

Existe-t-il un génome de référence "proche" ?
Séquençage profond ou normalisation de l'ADNc ?
But de l'étude par rapport aux limites d'un transcriptome de référence ?
Objectifs à court terme et objectifs à long terme ?
Protocole initial (états d'expression) ?
Protocole expérimental (réplicats et conditions) ?

Laissez-nous vous guider - de la conception à l'analyse

Exemples de projets utilisant le séquençage de transcriptome de référence:

Etude d'expression fonctionnelle sur un organisme avec une taxonomie approximative
Etudes d'amélioration et sélection génétique
Expression de gènes pour les phénotypes d'intérêts/sélectionnés

Applications liées au séquençage de transcriptome de référence:

RNA sequencing
small RNA sequencing

Déroulement

Le graphique ci-dessous illustre un déroulement typique d'un projet de transcriptome de référence. Veuillez noter que nos processus organisés en modules vous offrent diverses options d'entrée et de sortie.Vous pouvez externaliser l'ensemble de votre projet NGS à Microsynth ou seulement une partie de celui-ci, c'est à vous de décider.

Pour plus d'informations et une description technique détaillée, veuillez télécharger notre note de référence sur le séquençage des transcriptomes (voir les téléchargements correspondants).

Résultats

Notre module d'analyse fournit des informations de novo sur des transcriptomes précédemment inconnus. Les résultats fournis comprennent un aperçu général du transcriptome, des séquences de transcriptions et de leur annotation détaillée.

Informations sur le contenu en GC et la répartition par taille de transcrits assemblés. (voir figure 1)
Informations sur les séquences exactes de transcription. (voir tableau 1)
Annotation des séquences de transcription et liens avec les informations disponibles dans les bases de données publiques. (voir tableau 2)

Figure 1: Histogramme de répartition des tailles de transcrits et de leur contenu GC.

Table 1:Tableau de résultats listant deux exemples de transcrits

Table 2: Tableau de résultats listant en partie l'annotation pour les deux exemples de transcrits.

Délai d'exécution

Livraison des données dans les 30 jours ouvrables suivant la réception de l'échantillon (comprend la préparation et le séquençage de la bibliothèque)
10 jours ouvrables supplémentaires pour l'analyse des données (bioinformatique)
Service express possible sur demande