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Pathway Enrichment Analysis
Le module d'analyse de l'enrichissement des voies biologiques utilise les données du séquençage de l'ARN ou du ChIP et identifie les voies fonctionnelles qui sont régulées à la hausse ou à la baisse. L'analyse permet de visualiser l'influence de certains traitements ou conditions sur les mécanismes fonctionnels généraux dans l'organisme cible. Le module d'analyse des voies biologiques est limité aux organismes modèles eucaryotes communs (homme, souris, rat, etc.) pour lesquels des informations sur les voies sont disponibles.
Figure 1: Graphique de réseau pour les voies biologiques amplifiées. Trois domaines de l'ontologie génétique (composant cellulaire, processus biologique et fonction moléculaire) sont chacun affichés dans un graphique en réseau comme un aperçu des domaines de l'ontologie les plus significatifs
Figure 2: Détail d'un résultat d'analyse des voies de l'Encyclopédie des gènes et des génomes de Kyoto (KEGG).
Modules standards où le module d'analyse de l'enrichissement des voies peuvent être utilisés :