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Ecoli NightSeq

 
 
Nouveau service innovant de séquençage Sanger en tubes de 1,5 ml pour les plasmides. Déposez vos colonies d'E. coli dans une boîte de collecte Microsynth, recevez votre résultat le lendemain avant 14h et accélérez vos recherches d'une journée.


*Valable uniquement pour les boîtes de dépôt en Suisse, en France, et en Allemagne qui sont connectées à notre système de livraison le jour même.

Caractéristiques et Avantages

 
En plus des caractéristiques et des avantages que vous connaissez de l'Economy Run, l'Ecoli NightSeq offre les avantages suivants :
 
Rapide
  • Service de nuit, livraison des résultats avant 14 heures le jour suivant.
  • Les résultats sont livrés du lundi au vendredi
 
Pratique
  • Utilisez notre boîte de collecte à proximité pour l'envoi gratuit d'échantillons.
  • Vous pouvez choisir entre un service prépayé et non prépayé.
 
Robuste
  • Idéal pour les plasmides difficiles. Résultats meilleurs et plus robustes car l'ensemble du processus est normalisé et réalisé en interne.
 
Rentable
  • Accélérez vos recherches d'un jour ouvrable
  • Économisez du temps de manipulation au laboratoire
  • Réduisez considérablement vos dépenses en kits de purification de l'ADN plasmidique en isolant que les plasmides des clones présentant la séquence souhaitée.
 
Polyvalent
  • Pas limité à E. coli. La liste des organismes possibles s'élargit constamment.
 

Services Complémentaires

 
 
Le service Ecoli NightSeq est aussi disponible au format plaque.
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Comment Commander

 
 

1. Comment commander des étiquettes (prépayées ou non) :

  • Entrez dans notre boutique en ligne
  • Cliquez sur "Order labels" puis sur le service souhaité d' Ecoli NightSeq.
 

2. Comment enregistrer vos échantillons (prépayés ou non prépayés) :

  • Entrez dans notre boutique en ligne
  • Cliquez sur "Fill Order Form" sous "Ecoli NightSeq" et suivez les instructions
 
Voir aussi le guide d'utilisation de Microsynth sur la droite pour des informations plus détaillées.

FAQ

Questions Techniques

Est-il nécessaire d'ajouter des antibiotiques au liquide dans le tube ?

Non, il n'est pas nécessaire d'ajouter un antibiotique.

Dois-je vraiment choisir une colonie d'au moins 1 mm de diamètre ?

La colonie peut être un peu plus petite, mais elle doit être clairement visible.

Je veux inoculer le tube Ecoli NightSeq® et le strier sur une plaque de gélose avec le même cure-dent. Que dois-je faire en premier : inoculer le tube Ecoli NightSeq® ou strier ma plaque de gélose ?

Commencez par le tube Ecoli NightSeq®.

Le système Ecoli NightSeq® fonctionne-t-il également pour les plasmides low copy ?

Oui.

Je ne travaille pas avec des plaques de gélose, mais avec une culture liquide. Puis-je également inoculer les tubes Ecoli NightSeq® avec une culture liquide ?

Oui, veuillez ajouter 5 µl.

Pendant combien de temps Microsynth conserve-t-elle mes échantillons Ecoli NightSeq® ?

Les échantillons isolés sont disponibles pendant 1 mois.

Le système NightSeq® pour Ecoli fonctionne-t-il également pour les BAC ou d'autres organismes ?

Nous savons que l'Ecoli NightSeq® fonctionne avec des BAC et d'autres organismes, mais dans certains cas, pas aussi bien qu'avec E.coli. Nous vous recommandons d'effectuer des tests pilotes au préalable. Une bonne option pour améliorer la qualité est de faire un isolement brut du plasmide / BAC et d'ajouter 1 µl de cet isolat dans les tubes Ecoli NightSeq®.

Nous avons obtenu de bons résultats avec :

- Le prélèvement direct de Pseudomonas putida, Sinorhizobium meliloti, Fusobacterium nucleatum, Bacillus megaterium, Priestia megaterium. Nous recommandons d'essayer et en cas d'échec, d'isoler le plasmide et d'ajouter 1 µl dans nos tubes.
- Levure qui a été prétraitée dans 20mM NaOH à 95°C, 10 min. Ajouter 5 µl dans nos tubes Ecoli NightSeq® et chauffer à 95 °C, 15 min.

Stabilité

Combien de temps puis-je utiliser les tubes Ecoli NightSeq® ? Comment dois-je les conserver ?

Durée de stockage : 4 ans, Conditions de stockage : 4 °C. La date de péremption et les conditions de stockage sont indiquées sur le sac d'emballage.

Réactions multiples à partir d'un seul clone

Je voudrais choisir un clone et le séquencer avec une amorce de séquençage forward et reverse. Est-ce possible ?

Oui, vous avez deux possibilités :

  1. Prélever la colonie dans un tube Ecoli NightSeq®, la mélanger et transférer le liquide dans un second tube Ecoli NightSeq®, le mélanger à nouveau et répartir le liquide entre les deux tubes Ecoli NightSeq®. Le même nombre de cellules doit se trouver dans les deux tubes.
  2. Prélevez la colonie dans un tube Ecoli NightSeq® et étiquetez-la avec un code-barres. Envoyez-nous le tube Ecoli NightSeq® avec une deuxième étiquette Ecoli NightSeq® dans un sac en plastique transparent.


Dans les deux cas, vous devez enregistrer la réaction forward et la réaction reverse sur notre boutique en ligne.

Je voudrais effectuer une seconde réaction avec une amorce différente après avoir reçu le résultat de la première réaction. Est-ce possible ?

Oui, c'est possible pour les tubes. Procédez comme suit :

  1. Puisque Microsynth a déjà isolé votre plasmide, vous pouvez effectuer toute réaction de séquençage supplémentaire en utilisant le service Economy Run, moins cher. Pour cela, entrez dans le domaine de commande Economy Run, définissez la réaction supplémentaire en utilisant un code barre Economy Run prépayé.
  2. Sur la dernière page de la commande, veuillez ajouter les informations suivantes dans la case commentaire : Veuillez utiliser mon (mes) échantillon(s) de la commande numéro XY.

Veuillez noter :

  1. Les modèles isolés sont conservés pendant 4 semaines uniquement lors de l'utilisation du service Ecoli NightSeq.
  2. Les réactions supplémentaires sont effectuées dès que possible, mais notre promesse de durée n'est plus valable.
  3. Veuillez nous contacter si vous n'avez pas la possibilité d'utiliser les étiquettes prépayées Economy Run afin de trouver une solution alternative, comme l'utilisation de la version non prépayée du service Economy Run de Microsynth.

Logistique

Je n'ai pas de boîte de dépôt Microsynth à proximité. Puis-je aussi l'envoyer par courrier, même s'il arrive après le week-end ?

Oui. Nous avons testé un stockage de longue durée à température ambiante et cela n'endommage pas l'échantillon.

Est-ce que je reçois les résultats le samedi, lorsque je dépose les échantillons le vendredi dans la boîte de dépôt ?

Non, uniquement le lundi avant 14 heures.

Comment dois-je envoyer / étiqueter l'amorce de séquençage ?

De la même manière que pour nos autres types de services.
Concentration 10 µM, volume d'au moins 20 µl et écrire le nom de l'amorce sur le tube.

Témoignages

 
 
“Thanks to the new Ecoli NightSeq service from Microsynth, we are now able to sequence in high-throughput format and save up to two days compared to the previous service. Time really is money for us since we can significantly shorten critical project timelines. The easy sample preparation, the high-quality sequences, the long read-lengths as well as the competent, fast and uncomplicated customer support were convincing us, too.”
Andreas Lehmann, Molecular Partners AG

 

“We’ve been using the Ecoli NightSeq service proposed by Microsynth for 6 months now and have only seen advantages to the system. It allows you to save one day in your cloning process by sending directly your colonies for sequencing. The most important aspect is that you do not need to extract the DNA saving bench time and money. This reduces in effect the general price of the read. We’ve been surprised by the quality of the reads which you cannot distinguish from extracted DNA reads. Overall, it’s a plus!”

Thomas Lunardi, EPFL SV ISREC UPLIN

 

“I have used the Ecoli NightSeq service primarily to test whether a site directed mutagenesis has worked, as well as to check cloned CrisprCas9 plasmids. For such applications this service is very convenient, as they need to be confirmed with sequencing anyways and hence Ecoli NightSeq allowed me to save unnecessary minipreps.”

Barbara Hauert, University of Bern

 

“The main benefits of Ecoli NightSeq are saving one day as well as saving time and consumable costs for the mini-prep of 3-5 picked colonies from each clone. Another benefit is that Microsynth Seqlab provides the option for standard primers, which makes life easier for many constructs. In terms of quality, whenever poor sequence reads were found, Microsynth Seqlab has repeated the sequencing with no extra cost. Taken together, I’m extremely satisfied with the new Ecoli NightSeq service, an additional high standard sequencing service from Microsynth Seqlab.”

Dr. Shubhendu Palei, TU Dortmund

 

Vidéo du produit

 
 
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